El 53,52% de los habitantes de Merlo cuenta con algún tipo de cobertura de salud (prepaga, obra social, PAMI, programas estatales vinculados a políticas sociales). Este porcentaje es inferior al del Segundo Cordón, al del resto del Conurbano y al de la Provincia de Buenos Aires. La mayor diferencia se verifica con el total de la provincia, de la que se distancia por un porcentaje del 9%.